A origem do Shiatsu remonta há mais de cinco mil anos aos sacerdotes taoistas, das montanhas da China, que praticavam uma forma de manipulação corporal e de meditação para harmonizar a força vital (Ki em Japonês e Qi em chinês). Mais tarde, o conhecimento da medicina tradicional chinesa foi levado para o Japão sob várias formas de práticas (Acupunctura, Tui-na, Moxibustão, ... ), dando origem à Anma, entre outras terapias.
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O nome Shiatsu (Shi: Dedos e Atsu: pressão), surgiu no século XX como resultado da evolução da Anma sob novas influências, oriundas tanto de tradições orientais como da moderna ciência ocidental. Hoje em dia o Shiatsu é reconhecido por muitos terapeutas, médicos e mestres como um importante complemento à medicina moderna.
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No Japão, o Shiatsu associa-se oficialmente com a medicina ocidental sendo eleito como a terapia preventiva e complementar por excelência. Desde 1955 que o Ministério da Saúde e Bem-Estar do Japão integra o Shiatsu no sistema de saúde, como terapia manual preventiva e de reabilitação.